USP6

Ідентифікатори

Символи

USP6, HRP1, TRE17, TRE2, TRESMCR, Tre-2, USP6-short, ubiquitin specific peptidase 6

Зовнішні ІД

OMIM: 604334 HomoloGene: 136783 GeneCards: USP6

Онтологія гена
Молекулярна функція	• thiol-dependent deubiquitinase • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type endopeptidase activity • cysteine-type peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • nucleic acid binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • calmodulin binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • recycling endosome • ендосома • клітинна мембрана • лізосома • мембрана
Біологічний процес	• protein deubiquitination • regulation of vesicle-mediated transport • ubiquitin-dependent protein catabolic process • протеоліз • intracellular protein transport • regulation of vesicle fusion • GO:0032861, GO:0032862, GO:0032856 activation of GTPase activity
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9098


н/д

Ensembl


ENSG00000129204


н/д

UniProt


P35125


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_001304284 NM_004505 NM_005152


н/д

RefSeq (білок)


NP_001291213 NP_004496


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 17: 5.12 – 5.18 Mb

н/д

PubMed search

^[1]

н/д

Вікідані

Див./Ред. для людей

USP6 (англ. Ubiquitin specific peptidase 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 406 амінокислот, а молекулярна маса — 158 658^[3].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDMVENADSL	QAQERKDILM	KYDKGHRAGL	PEDKGPEPVG	INSSIDRFGI
LHETELPPVT	AREAKKIRRE	MTRTSKWMEM	LGEWETYKHS	SKLIDRVYKG
IPMNIRGPVW	SVLLNIQEIK	LKNPGRYQIM	KERGKRSSEH	IHHIDLDVRT
TLRNHVFFRD	RYGAKQRELF	YILLAYSEYN	PEVGYCRDLS	HITALFLLYL
PEEDAFWALV	QLLASERHSL	PGFHSPNGGT	VQGLQDQQEH	VVPKSQPKTM
WHQDKEGLCG	QCASLGCLLR	NLIDGISLGL	TLRLWDVYLV	EGEQVLMPIT
SIALKVQQKR	LMKTSRCGLW	ARLRNQFFDT	WAMNDDTVLK	HLRASTKKLT
RKQGDLPPPA	KREQGSLAPR	PVPASRGGKT	LCKGYRQAPP	GPPAQFQRPI
CSASPPWASR	FSTPCPGGAV	REDTYPVGTQ	GVPSLALAQG	GPQGSWRFLE
WKSMPRLPTD	LDIGGPWFPH	YDFEWSCWVR	AISQEDQLAT	CWQAEHCGEV
HNKDMSWPEE	MSFTANSSKI	DRQKVPTEKG	ATGLSNLGNT	CFMNSSIQCV
SNTQPLTQYF	ISGRHLYELN	RTNPIGMKGH	MAKCYGDLVQ	ELWSGTQKSV
APLKLRRTIA	KYAPKFDGFQ	QQDSQELLAF	LLDGLHEDLN	RVHEKPYVEL
KDSDGRPDWE	VAAEAWDNHL	RRNRSIIVDL	FHGQLRSQVK	CKTCGHISVR
FDPFNFLSLP	LPMDSYMDLE	ITVIKLDGTT	PVRYGLRLNM	DEKYTGLKKQ
LRDLCGLNSE	QILLAEVHDS	NIKNFPQDNQ	KVQLSVSGFL	CAFEIPVPSS
PISASSPTQI	DFSSSPSTNG	MFTLTTNGDL	PKPIFIPNGM	PNTVVPCGTE
KNFTNGMVNG	HMPSLPDSPF	TGYIIAVHRK	MMRTELYFLS	PQENRPSLFG
MPLIVPCTVH	TRKKDLYDAV	WIQVSWLARP	LPPQEASIHA	QDRDNCMGYQ
YPFTLRVVQK	DGNSCAWCPQ	YRFCRGCKID	CGEDRAFIGN	AYIAVDWHPT
ALHLRYQTSQ	ERVVDKHESV	EQSRRAQAEP	INLDSCLRAF	TSEEELGESE
MYYCSKCKTH	CLATKKLDLW	RLPPFLIIHL	KRFQFVNDQW	IKSQKIVRFL
RESFDPSAFL	VPRDPALCQH	KPLTPQGDEL	SKPRILAREV	KKVDAQSSAG
KEDMLLSKSP	SSLSANISSS	PKGSPSSSRK	SGTSCPSSKN	SSPNSSPRTL
GRSKGRLRLP	QIGSKNKPSS	SKKNLDASKE	NGAGQICELA	DALSRGHMRG
GSQPELVTPQ	DHEVALANGF	LYEHEACGNG	CGDGYSNGQL	GNHSEEDSTD
DQREDTHIKP	IYNLYAISCH	SGILSGGHYI	TYAKNPNCKW	YCYNDSSCEE
LHPDEIDTDS	AYILFYEQQG	IDYAQFLPKI	DGKKMADTSS	TDEDSESDYE
KYSMLQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою кальмодуліну. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, ендосомах.

Література

Paulding C.A., Ruvolo M., Haber D.A. (2003). The Tre2 (USP6) oncogene is a hominoid-specific gene. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 2507—2511. PMID 12604796 DOI:10.1073/pnas.0437015100
Papa F.R., Hochstrasser M. (1993). The yeast DOA4 gene encodes a deubiquitinating enzyme related to a product of the human tre-2 oncogene. Nature. 366: 313—319. PMID 8247125 DOI:10.1038/366313a0
Masuda-Robens J.M., Kutney S.N., Qi H., Chou M.M. (2003). The TRE17 oncogene encodes a component of a novel effector pathway for Rho GTPases Cdc42 and Rac1 and stimulates actin remodeling. Mol. Cell. Biol. 23: 2151—2161. PMID 12612085 DOI:10.1128/MCB.23.6.2151-2161.2003

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12629 (англ.) . Архів оригіналу за 15 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, P35125 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.