TNFRSF1B

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1CA9, 3ALQ

Ідентифікатори

Символи

TNFRSF1B, CD120b, TBPII, TNF-R-II, TNF-R75, TNFBR, TNFR1B, TNFR2, TNFR80, p75, p75TNFR, tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, TNF receptor superfamily member 1B

Зовнішні ІД

OMIM: 191191 MGI: 1314883 HomoloGene: 829 GeneCards: TNFRSF1B

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin protein ligase binding • tumor necrosis factor-activated receptor activity • tumor necrosis factor binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • varicosity • extracellular region • аксон • neuronal cell body • perinuclear region of cytoplasm • membrane raft • клітинне ядро • specific granule membrane • tumor necrosis factor receptor superfamily complex
Біологічний процес	• extrinsic apoptotic signaling pathway • RNA destabilization • cellular response to growth factor stimulus • positive regulation of membrane protein ectodomain proteolysis • GO:0010260 старіння людини • multicellular organism development • cell surface receptor signaling pathway • response to lipopolysaccharide • regulation of cell population proliferation • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage • apoptotic signaling pathway • inflammatory response • cellular response to lipopolysaccharide • negative regulation of inflammatory response • GO:0097285 апоптоз • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • neutrophil degranulation • negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • cytokine-mediated signaling pathway • aortic valve development • pulmonary valve development • negative regulation of extracellular matrix constituent secretion • negative regulation of cardiac muscle hypertrophy • positive regulation of apoptotic process involved in morphogenesis • regulation of T cell cytokine production • regulation of myelination • regulation of T cell proliferation • regulation of neuroinflammatory response • cellular response to tumor necrosis factor • positive regulation of myelination • positive regulation of oligodendrocyte differentiation • negative regulation of cell death • negative regulation of neuroinflammatory response • glial cell-neuron signaling • negative regulation of neuron death • regulation of RNA biosynthetic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7133


21938

Ensembl


ENSG00000028137


ENSMUSG00000028599

UniProt


P20333


P25119

RefSeq (мРНК)


NM_001066


NM_011610

RefSeq (білок)


NP_001057


NP_035740

Локус (UCSC)

Хр. 1: 12.17 – 12.21 Mb

Хр. 4: 144.94 – 144.97 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TNFRSF1B (англ. TNF receptor superfamily member 1B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 461 амінокислот, а молекулярна маса — 48 291^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAPVAVWAAL	AVGLELWAAA	HALPAQVAFT	PYAPEPGSTC	RLREYYDQTA
QMCCSKCSPG	QHAKVFCTKT	SDTVCDSCED	STYTQLWNWV	PECLSCGSRC
SSDQVETQAC	TREQNRICTC	RPGWYCALSK	QEGCRLCAPL	RKCRPGFGVA
RPGTETSDVV	CKPCAPGTFS	NTTSSTDICR	PHQICNVVAI	PGNASMDAVC
TSTSPTRSMA	PGAVHLPQPV	STRSQHTQPT	PEPSTAPSTS	FLLPMGPSPP
AEGSTGDFAL	PVGLIVGVTA	LGLLIIGVVN	CVIMTQVKKK	PLCLQREAKV
PHLPADKARG	TQGPEQQHLL	ITAPSSSSSS	LESSASALDR	RAPTRNQPQA
PGVEASGAGE	ARASTGSSDS	SPGGHGTQVN	VTCIVNVCSS	SDHSSQCSSQ
ASSTMGDTDS	SPSESPKDEQ	VPFSKEECAF	RSQLETPETL	LGSTEEKPLP
LGVPDAGMKP	S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Tsuchiya N., Komata T., Matsushita M., Ohashi J., Tokunaga K. (2000). New single nucleotide polymorphisms in the coding region of human TNFR2: association with systemic lupus erythematosus. Genes Immun. 1: 501—503. PMID 11197692 DOI:10.1038/sj.gene.6363700
Rothe M., Wong S.C., Henzel W.J., Goeddel D.V. (1994). A novel family of putative signal transducers associated with the cytoplasmic domain of the 75 kDa tumor necrosis factor receptor. Cell. 78: 681—692. PMID 8069916 DOI:10.1016/0092-8674(94)90532-0
Park Y.C., Burkitt V., Villa A.R., Tong L., Wu H. (1999). Structural basis for self-association and receptor recognition of human TRAF2. Nature. 398: 533—538. PMID 10206649 DOI:10.1038/19110
Peral B., San Millan J.L., Castello R., Moghetti P., Escobar-Morreale H.F. (2002). Comment: the methionine 196 arginine polymorphism in exon 6 of the TNF receptor 2 gene (TNFRSF1B) is associated with the polycystic ovary syndrome and hyperandrogenism. J. Clin. Endocrinol. Metab. 87: 3977—3983. PMID 12161545 DOI:10.1210/jcem.87.8.8715
Engelmann H., Novick D., Wallach D. (1990). Two tumor necrosis factor-binding proteins purified from human urine. Evidence for immunological cross-reactivity with cell surface tumor necrosis factor receptors. J. Biol. Chem. 265: 1531—1536. PMID 2153136

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11917 (англ.) . Архів оригіналу за 25 травня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.
↑ UniProt, P20333 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

п о р Білки: кластери диференціації

1-50	CD1 a-c 1A 1D 1E CD2 CD3^[en] γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50

51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64^[en] A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100

101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150

151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200

201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249

251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299

301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350