TET3

Ідентифікатори

Символи

TET3, hCG_40738, tet methylcytosine dioxygenase 3, BEFAHRS

Зовнішні ІД

OMIM: 613555 MGI: 2446229 HomoloGene: 35360 GeneCards: TET3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • dioxygenase activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • oxidoreductase activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • methylcytosine dioxygenase activity • iron ion binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • клітинне ядро • хромосома • female pronucleus • male pronucleus
Біологічний процес	• histone H3-K4 trimethylation • protein O-linked glycosylation • multicellular organism development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • DNA demethylation of male pronucleus • DNA demethylation • 5-methylcytosine catabolic process • oxidative demethylation
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


200424


194388

Ensembl


ENSG00000187605


ENSMUSG00000034832

UniProt


O43151


Q8BG87

RefSeq (мРНК)


NM_001287491 NM_001366022


NM_183138 NM_001347313

RefSeq (білок)


NP_001274420 NP_001352951


NP_001334242 NP_898961

Локус (UCSC)

Хр. 2: 73.98 – 74.11 Mb

Хр. 6: 83.34 – 83.44 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TET3 (англ. Tet methylcytosine dioxygenase 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 2-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 660 амінокислот, а молекулярна маса — 179 350^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDSGPVYHGD	SRQLSASGVP	VNGAREPAGP	SLLGTGGPWR	VDQKPDWEAA
PGPAHTARLE	DAHDLVAFSA	VAEAVSSYGA	LSTRLYETFN	REMSREAGNN
SRGPRPGPEG	CSAGSEDLDT	LQTALALARH	GMKPPNCNCD	GPECPDYLEW
LEGKIKSVVM	EGGEERPRLP	GPLPPGEAGL	PAPSTRPLLS	SEVPQISPQE
GLPLSQSALS	IAKEKNISLQ	TAIAIEALTQ	LSSALPQPSH	STPQASCPLP
EALSPPAPFR	SPQSYLRAPS	WPVVPPEEHS	SFAPDSSAFP	PATPRTEFPE
AWGTDTPPAT	PRSSWPMPRP	SPDPMAELEQ	LLGSASDYIQ	SVFKRPEALP
TKPKVKVEAP	SSSPAPAPSP	VLQREAPTPS	SEPDTHQKAQ	TALQQHLHHK
RSLFLEQVHD	TSFPAPSEPS	APGWWPPPSS	PVPRLPDRPP	KEKKKKLPTP
AGGPVGTEKA	APGIKPSVRK	PIQIKKSRPR	EAQPLFPPVR	QIVLEGLRSP
ASQEVQAHPP	APLPASQGSA	VPLPPEPSLA	LFAPSPSRDS	LLPPTQEMRS
PSPMTALQPG	STGPLPPADD	KLEELIRQFE	AEFGDSFGLP	GPPSVPIQDP
ENQQTCLPAP	ESPFATRSPK	QIKIESSGAV	TVLSTTCFHS	EEGGQEATPT
KAENPLTPTL	SGFLESPLKY	LDTPTKSLLD	TPAKRAQAEF	PTCDCVEQIV
EKDEGPYYTH	LGSGPTVASI	RELMEERYGE	KGKAIRIEKV	IYTGKEGKSS
RGCPIAKWVI	RRHTLEEKLL	CLVRHRAGHH	CQNAVIVILI	LAWEGIPRSL
GDTLYQELTD	TLRKYGNPTS	RRCGLNDDRT	CACQGKDPNT	CGASFSFGCS
WSMYFNGCKY	ARSKTPRKFR	LAGDNPKEEE	VLRKSFQDLA	TEVAPLYKRL
APQAYQNQVT	NEEIAIDCRL	GLKEGRPFAG	VTACMDFCAH	AHKDQHNLYN
GCTVVCTLTK	EDNRCVGKIP	EDEQLHVLPL	YKMANTDEFG	SEENQNAKVG
SGAIQVLTAF	PREVRRLPEP	AKSCRQRQLE	ARKAAAEKKK	IQKEKLSTPE
KIKQEALELA	GITSDPGLSL	KGGLSQQGLK	PSLKVEPQNH	FSSFKYSGNA
VVESYSVLGN	CRPSDPYSMN	SVYSYHSYYA	QPSLTSVNGF	HSKYALPSFS
YYGFPSSNPV	FPSQFLGPGA	WGHSGSSGSF	EKKPDLHALH	NSLSPAYGGA
EFAELPSQAV	PTDAHHPTPH	HQQPAYPGPK	EYLLPKAPLL	HSVSRDPSPF
AQSSNCYNRS	IKQEPVDPLT	QAEPVPRDAG	KMGKTPLSEV	SQNGGPSHLW
GQYSGGPSMS	PKRTNGVGGS	WGVFSSGESP	AIVPDKLSSF	GASCLAPSHF
TDGQWGLFPG	EGQQAASHSG	GRLRGKPWSP	CKFGNSTSAL	AGPSLTEKPW
ALGAGDFNSA	LKGSPGFQDK	LWNPMKGEEG	RIPAAGASQL	DRAWQSFGLP
LGSSEKLFGA	LKSEEKLWDP	FSLEEGPAEE	PPSKGAVKEE	KGGGGAEEEE
EELWSDSEHN	FLDENIGGVA	VAPAHGSILI	ECARRELHAT	TPLKKPNRCH
PTRISLVFYQ	HKNLNQPNHG	LALWEAKMKQ	LAERARARQE	EAARLGLGQQ
EAKLYGKKRK	WGGTVVAEPQ	QKEKKGVVPT	RQALAVPTDS	AVTVSSYAYT
KVTGPYSRWI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, регуляторів хроматину, білків розвитку. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном заліза, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Chen Q., Chen Y., Bian C., Fujiki R., Yu X. (2013). TET2 promotes histone O-GlcNAcylation during gene transcription. Nature. 493: 561—564. PMID 23222540 DOI:10.1038/nature11742

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:28313 (англ.) . Процитовано 18 вересня 2017.
↑ UniProt, O43151 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 18 вересня 2017.