SMC5

Ідентифікатори

Символи

SMC5, SMC5L1, structural maintenance of chromosomes 5

Зовнішні ІД

OMIM: 609386 MGI: 2385088 HomoloGene: 41009 GeneCards: SMC5

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding
Клітинна компонента	• site of double-strand break • PML body • Smc5-Smc6 complex • хромосома • теломера • міжклітинні контакти • interchromatin granule • клітинне ядро • нуклеоплазма • nuclear speck • Статеві хромосоми
Біологічний процес	• DNA recombination • positive regulation of maintenance of mitotic sister chromatid cohesion • cellular response to DNA damage stimulus • поділ клітини • telomere maintenance via recombination • клітинне старіння • positive regulation of chromosome segregation • double-strand break repair via homologous recombination • клітинний цикл • double-strand break repair via nonhomologous end joining • GO:0100026 Репарація ДНК • sister chromatid cohesion
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23137


226026

Ensembl


ENSG00000198887


ENSMUSG00000024943

UniProt


Q8IY18


Q8CG46

RefSeq (мРНК)


NM_015110


NM_001252684 NM_001252685 NM_153808

RefSeq (білок)


NP_055925


NP_001239613 NP_001239614 NP_722503

Локус (UCSC)

Хр. 9: 70.26 – 70.35 Mb

Хр. 19: 23.18 – 23.25 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SMC5 (англ. Structural maintenance of chromosomes 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 101 амінокислот, а молекулярна маса — 128 806^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATPSKKTST	PSPQPSKRAL	PRDPSSEVPS	KRKNSAPQLP	LLQSSGPFVE
GSIVRISMEN	FLTYDICEVS	PGPHLNMIVG	ANGTGKSSIV	CAICLGLAGK
PAFMGRADKV	GFFVKRGCSR	GMVEIELFRA	SGNLVITREI	DVAKNQSFWF
INKKSTTQKI	VEEKVAALNI	QVGNLCQFLP	QDKVGEFAKL	SKIELLEATE
KSIGPPEMHK	YHCELKNLRE	KEKQLETSCK	EKTEYLQKMV	QRNERYKQDV
ERFYERKRHL	DLIEMLEAKR	PWVEYENVRQ	EYEEVKLVRD	RVKEEVRKLK
EGQIPVTCRI	EEMENERHNL	EARIKEKATD	IKEASQKCKQ	KQDVIERKDK
HIEELQQALI	VKQNEELDRQ	RRIGNTRKMI	EDLQNELKTT	ENCENLQPQI
DAITNDLRRI	QDEKALCEGE	IIDKRRERET	LEKEKKSVDD	HIVRFDNLMN
QKEDKLRQRF	RDTYDAVLWL	RNNRDKFKQR	VCEPIMLTIN	MKDNKNAKYI
ENHIPSNDLR	AFVFESQEDM	EVFLKEVRDN	KKLRVNAVIA	PKSSYADKAP
SRSLNELKQY	GFFSYLRELF	DAPDPVMSYL	CCQYHIHEVP	VGTEKTRERI
ERVIQETRLK	QIYTAEEKYV	VKTSFYSNKV	ISSNTSLKVA	QFLTVTVDLE
QRRHLEEQLK	EIHRKLQAVD	SGLIALRETS	KHLEHKDNEL	RQKKKELLER
KTKKRQLEQK	ISSKLGSLKL	MEQDTCNLEE	EERKASTKIK	EINVQKAKLV
TELTNLIKIC	TSLHIQKVDL	ILQNTTVISE	KNKLESDYMA	ASSQLRLTEQ
HFIELDENRQ	RLLQKCKELM	KRARQVCNLG	AEQTLPQEYQ	TQVPTIPNGH
NSSLPMVFQD	LPNTLDEIDA	LLTEERSRAS	CFTGLNPTIV	QEYTKREEEI
EQLTEELKGK	KVELDQYREN	ISQVKERWLN	PLKELVEKIN	EKFSNFFSSM
QCAGEVDLHT	ENEEDYDKYG	IRIRVKFRSS	TQLHELTPHH	QSGGERSVST
MLYLMALQEL	NRCPFRVVDE	INQGMDPINE	RRVFEMVVNT	ACKENTSQYF
FITPKLLQNL	PYSEKMTVLF	VYNGPHMLEP	NTWNLKAFQR	RRRRITFTQP
S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, пошкодження ДНК, репарація ДНК, мітоз, рекомбінація ДНК. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Potts P.R., Yu H. (2005). Human MMS21/NSE2 is a SUMO ligase required for DNA repair. Mol. Cell. Biol. 25: 7021—7032. PMID 16055714 DOI:10.1128/MCB.25.16.7021-7032.2005
Potts P.R., Porteus M.H., Yu H. (2006). Human SMC5/6 complex promotes sister chromatid homologous recombination by recruiting the SMC1/3 cohesin complex to double-strand breaks. EMBO J. 25: 3377—3388. PMID 16810316 DOI:10.1038/sj.emboj.7601218
Potts P.R., Yu H. (2007). The SMC5/6 complex maintains telomere length in ALT cancer cells through SUMOylation of telomere-binding proteins. Nat. Struct. Mol. Biol. 14: 581—590. PMID 17589526 DOI:10.1038/nsmb1259
Taylor E.M., Copsey A.C., Hudson J.J., Vidot S., Lehmann A.R. (2008). Identification of the proteins, including MAGEG1, that make up the human SMC5-6 protein complex. Mol. Cell. Biol. 28: 1197—1206. PMID 18086888 DOI:10.1128/MCB.00767-07
Behlke-Steinert S., Touat-Todeschini L., Skoufias D.A., Margolis R.L. (2009). SMC5 and MMS21 are required for chromosome cohesion and mitotic progression. Cell Cycle. 8: 2211—2218. PMID 19502785 DOI:10.4161/cc.8.14.8979

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20465 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8IY18 (англ.) . Архів оригіналу за 25 лютого 2018. Процитовано 8 вересня 2017.