SARM1

Ідентифікатори

Символи

SARM1, MyD88-5, SAMD2, SARM, sterile alpha and TIR motif containing 1, hHsTIR

Зовнішні ІД

OMIM: 607732 MGI: 2136419 HomoloGene: 9015 GeneCards: SARM1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • signaling adaptor activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • cell projection • microtubule cytoskeleton • синапс • extrinsic component of mitochondrial outer membrane • аксон • міжклітинні контакти • мітохондрія • мікротрубочка • дендрит (нейробіологія)
Біологічний процес	• regulation of apoptotic process • диференціація клітин • процес імунної системи • response to glucose • нейробіологія розвитку • regulation of dendrite morphogenesis • negative regulation of MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway • вроджений імунітет • GO:0072468 сигнальна трансдукція • regulation of neuron death • positive regulation of signal transduction • response to axon injury
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23098


237868

Ensembl


ENSG00000004139


ENSMUSG00000050132

UniProt


Q6SZW1 Q0D2N8


Q6PDS3

RefSeq (мРНК)


NM_015077


NM_001168521 NM_172795

RefSeq (білок)


NP_055892 NP_055892.2


NP_001161993 NP_766383

Локус (UCSC)

Хр. 17: 28.36 – 28.4 Mb

Хр. 11: 78.36 – 78.39 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SARM1 (англ. Sterile alpha and TIR motif containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 724 амінокислот, а молекулярна маса — 79 388^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVLTLLLSAY	KLCRFFAMSG	PRPGAERLAV	PGPDGGGGTG	PWWAAGGRGP
REVSPGAGTE	VQDALERALP	ELQQALSALK	QAGGARAVGA	GLAEVFQLVE
EAWLLPAVGR	EVAQGLCDAI	RLDGGLDLLL	RLLQAPELET	RVQAARLLEQ
ILVAENRDRV	ARIGLGVILN	LAKEREPVEL	ARSVAGILEH	MFKHSEETCQ
RLVAAGGLDA	VLYWCRRTDP	ALLRHCALAL	GNCALHGGQA	VQRRMVEKRA
AEWLFPLAFS	KEDELLRLHA	CLAVAVLATN	KEVEREVERS	GTLALVEPLV
ASLDPGRFAR	CLVDASDTSQ	GRGPDDLQRL	VPLLDSNRLE	AQCIGAFYLC
AEAAIKSLQG	KTKVFSDIGA	IQSLKRLVSY	STNGTKSALA	KRALRLLGEE
VPRPILPSVP	SWKEAEVQTW	LQQIGFSKYC	ESFREQQVDG	DLLLRLTEEE
LQTDLGMKSG	ITRKRFFREL	TELKTFANYS	TCDRSNLADW	LGSLDPRFRQ
YTYGLVSCGL	DRSLLHRVSE	QQLLEDCGIH	LGVHRARILT	AAREMLHSPL
PCTGGKPSGD	TPDVFISYRR	NSGSQLASLL	KVHLQLHGFS	VFIDVEKLEA
GKFEDKLIQS	VMGARNFVLV	LSPGALDKCM	QDHDCKDWVH	KEIVTALSCG
KNIVPIIDGF	EWPEPQVLPE	DMQAVLTFNG	IKWSHEYQEA	TIEKIIRFLQ
GRSSRDSSAG	SDTSLEGAAP	MGPT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мітохондрії, клітинних контактах, клітинних відростках, синапсах.

Література

Mink M., Fogelgren B., Olszewski K., Maroy P., Csiszar K. (2001). A novel human gene (SARM) at chromosome 17q11 encodes a protein with a SAM motif and structural similarity to Armadillo/beta-catenin that is conserved in mouse, Drosophila, and Caenorhabditis elegans. Genomics. 74: 234—244. PMID 11386760 DOI:10.1006/geno.2001.6548
O'Neill L.A.J. (2006). DisSARMing Toll-like receptor signaling. Nat. Immunol. 7: 1023—1025. PMID 16985498 DOI:10.1038/ni1006-1023
Dalod M. (2007). Studies of SARM1 uncover similarities between immune and neuronal responses to danger. Sci. STKE. 2007: PE73—PE73. PMID 18089857 DOI:10.1126/stke.4172007pe73
Panneerselvam P., Singh L.P., Ho B., Chen J., Ding J.L. (2012). Targeting of pro-apoptotic TLR adaptor SARM to mitochondria: definition of the critical region and residues in the signal sequence. Biochem. J. 442: 263—271. PMID 22145856 DOI:10.1042/BJ20111653

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17074 (англ.) . Процитовано 21 вересня 2017.
↑ UniProt, Q6SZW1 (англ.) . Архів оригіналу за 29 вересня 2017. Процитовано 21 вересня 2017.