PNRC2 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

PNRC2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4B6H

Ідентифікатори

Символи

PNRC2, proline rich nuclear receptor coactivator 2

Зовнішні ІД

OMIM: 611882 MGI: 106512 HomoloGene: 9821 GeneCards: PNRC2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• P-body • клітинне ядро • цитоплазма • нуклеоплазма • комплекс Ґольджі • гіалоплазма
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • deadenylation-independent decapping of nuclear-transcribed mRNA • transcription, DNA-templated • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


55629


52830

Ensembl


ENSG00000189266


ENSMUSG00000028675

UniProt


Q9NPJ4


Q9CR73

RefSeq (мРНК)


NM_017761


NM_026383

RefSeq (білок)


NP_060231


NP_080659

Локус (UCSC)

Хр. 1: 23.96 – 23.96 Mb

Хр. 4: 135.6 – 135.6 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PNRC2 (англ. Proline rich nuclear receptor coactivator 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 139 амінокислот, а молекулярна маса — 15 591^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGGGERYNIP	APQSRNVSKN	QQQLNRQKTK	EQNSQMKIVH	KKKERGHGYN
SSAAAWQAMQ	NGGKNKNFPN	NQSWNSSLSG	PRLLFKSQAN	QNYAGAKFSE
PPSPSVLPKP	PSHWVPVSFN	PSDKEIMTFQ	LKTLLKVQV

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hentschke M., Borgmeyer U. (2003). Identification of PNRC2 and TLE1 as activation function-1 cofactors of the orphan nuclear receptor ERRgamma. Biochem. Biophys. Res. Commun. 312: 975—982. PMID 14651967 DOI:10.1016/j.bbrc.2003.11.025
Cho H., Kim K.M., Kim Y.K. (2009). Human proline-rich nuclear receptor coregulatory protein 2 mediates an interaction between mRNA surveillance machinery and decapping complex. Mol. Cell. 33: 75—86. PMID 19150429 DOI:10.1016/j.molcel.2008.11.022
Zhou D., Chen S. (2001). PNRC2 is a 16 kDa coactivator that interacts with nuclear receptors through an SH3-binding motif. Nucleic Acids Res. 29: 3939—3948. PMID 11574675

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23158 (англ.) . Архів оригіналу за 21 березня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9NPJ4 (англ.) . Архів оригіналу за 7 листопада 2016. Процитовано 28 серпня 2017.