Ras superfamilija

H-Ras struktura PDB 121p​. Površina je obojena po stepenu konzervacije: zlatno - najočuvaniji deo.
Identifikatori
SimbolRas
PfamPF00071
InterProIPR013753
PROSITEPDOC00017
SCOP5p21
SUPERFAMILY5p21
OPM protein1uad
CDDcd00882
Dostupne proteinske strukture:
Pfamstructures
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumstructure summary

Ras superfamilija je proteinska superfamilija malih GTPaza, koje su međusobno srodne u izvesnoj meri sa Ras potfamilijom. Ključni ljudski članovi su KRAS, NRAS, i HRAS.

Postoji više od sto proteina u Ras superfamiliji.[1] Ras superfamilija se deli u osam glavnih familija na osnovu strukture, sekvence i funkcije: Ras, Rad, Rab, Rap, Ran, Ro, Rheb, Rit, i Arf. Miro je nedavni dodatak superfamiliji.

Svaka potfamilija ima zajednički osnovni G domen, koji omogućava esencijalne funkcije GTPaze i nukleotidne razmene.

Okružujuća sekvenca pomaže u određivanju funkcionalne specifičnosti malih GTPaza, na primer umetnuta petlja koja je uobičajena kod Ro potfamilije, specifično doprinosi vezivanju za efektorske proteine poput IQGAP-a i WASP-a.

Ras familija je generalno odgovorna za ćelijsku proliferaciju, Ro za ćelijsku morfologiju, Ran za nuklearni transport, a Rab i Arf za vezikularni transport[2].

Potfamilije i članovi

Sledeća lista sadrži ljudske proteine koji pripadaju Ras superfamiliji:[1]

Pregled
Potfamilija Funkcija Članovi
Ras ćelijska proliferacija[2] DIRAS1; DIRAS2; DIRAS3; ERAS; GEM; HRAS; KRAS; MRAS; NKIRAS1; NKIRAS2; NRAS; RALA; RALB; RAP1A; RAP1B; RAP2A; RAP2B; RAP2C; RASD1; RASD2; RASL10A; RASL10B; RASL11A; RASL11B; RASL12; REM1; REM2; RERG; RERGL; RRAD; RRAS; RRAS2
Ro citoskeletalna dinamika/morfologija[2] RHOA; RHOB; RHOBTB1; RHOBTB2; RHOBTB3; RHOC; RHOD; RHOF; RHOG; RHOH; RHOJ; RHOQ; RHOU; RHOV; RND1; RND2; RND3; RAC1; RAC2; RAC3; CDC42
Rab membranska razmena RAB1A; RAB1B; RAB2; RAB3A; RAB3B; RAB3C; RAB3D; RAB4A; RAB4B; RAB5A; RAB5B; RAB5C; RAB6A; RAB6B; RAB6C; RAB7A; RAB7B; RAB7L1; RAB8A; RAB8B; RAB9; RAB9B; RABL2A; RABL2B; RABL4; RAB10; RAB11A; RAB11B; RAB12; RAB13; RAB14; RAB15; RAB17; RAB18; RAB19; RAB20; RAB21; RAB22A; RAB23; RAB24; RAB25; RAB26; RAB27A; RAB27B; RAB28; RAB2B; RAB30; RAB31; RAB32; RAB33A; RAB33B; RAB34; RAB35; RAB36; RAB37; RAB38; RAB39; RAB39B; RAB40A; RAB40AL; RAB40B; RAB40C; RAB41; RAB42; RAB43
Rap Ćelijska adhezija RAP1A; RAP1B; RAP2A; RAP2B; RAP2C
Arf vesicular transport[2] ARF1; ARF3; ARF4; ARF5; ARF6; ARL1; ARL2; ARL3; ARL4; ARL5; ARL5C; ARL6; ARL7; ARL8; ARL9; ARL10A; ARL10B; ARL10C; ARL11; ARL13A; ARL13B; ARL14; ARL15; ARL16; ARL17; TRIM23, ARL4D; ARFRP1; ARL13B
Ran nukleusni transport RAN
Rheb mTOR put RHEB; RHEBL1
RGK RRAD; GEM; REM; REM2
Rit RIT1; RIT2
Miro mitochondrial transport RHOT1; RHOT2

Neklasifikovani:

  • ARHGAP5
  • DNAJC27
  • GRLF1
  • RASEF

Reference

  1. ^ а б Wennerberg K, Rossman KL, Der CJ (2005). „The Ras superfamily at a glance”. J. Cell. Sci. 118 (Pt 5): 843—6. PMID 15731001. doi:10.1242/jcs.01660. 
  2. ^ а б в г Munemitsu S, Innis M, Clark R, McCormick F, Ullrich A, Polakis P (1990). „Molecular cloning and experssion of a G25K cDNA, the human homolog of the yeast cell cycle gene CDC42”. Mol Cell Biol. 10 (11): 5977—82. ISSN 0270-7306. PMC 361395 Слободан приступ. PMID 2122236. 

Vidi još

  • п
  • р
  • у
3.6.1
Pirofosfataza (Neorganska, Tiamin) · Apiraza · Tiamin trifosfataza
3.6.23.6.3-4: ATPaza
3.6.3
Cu++ (3.6.3.4)
Menkes/ATP7A · Vilson/ATP7B
Ca+ (3.6.3.8)
SERCA (ATP2A1, ATP2A2, ATP2A3) · Membrana plazme (ATP2B1, ATP2B2, ATP2B3, ATP2B4) · SPCA (ATP2C1, ATP2C2)
Na+/K+ (3.6.3.9)
ATP1A1 · ATP1A2 · ATP1A3 · ATP1A4 · ATP1B1 · ATP1B2 · ATP1B3 · ATP1B4
H+/K+ (3.6.3.10)
ATP4A
Druge P-tip ATPaze
ATP8B1 · ATP10A · ATP11B · ATP12A · ATP13A2 · ATP13A3 ·
3.6.4
3.6.5: GTPaze
3.6.5.1: Heterotrimerni G protein
Gαs · Gαi (GNAI1, GNAI2, GNAI3) · Gαq/11 (GNAQ, GNA11) · Gα12/13 (GNA12, GNA13) · Transducin (GNAT1, GNAT2)
3.6.5.2: Male GTPaze > Ras superfamilija
Ras · Rab (Rab27) · Arf (Arf6) · Ran · Rheb · Ro familija (RhoA, RhoB, CDC42, Rac1) · Rap
3.6.5.3: GTPaza proteinske sinteze
Prokariotski (IF-2, EF-Tu, EF-G) · Eukariotski
3.6.5.5-6: Polimerizacioni motori
B enzm: 1.1/2/3/4/5/6/7/8/10/11/13/14/15-18, 2.1/2/3/4/5/6/7/8, 2.7.10, 2.7.11-12, 3.1/2/3/4/5/6/7, 3.1.3.48, 3.4.21/22/23/24, 4.1/2/3/4/5/6, 5.1/2/3/4/99, 6.1-3/4/5-6